Con la ayuda de brujas, un aeronauta y un oso blindado, liras y viajeros acuáticos, los egipcios asaltan la estación de investigación de la Sra. Coulter y liberan a los niños supervivientes. Lyra ayuda al oso blindado Iorek, un rey exiliado, a recuperar su trono, y ella y Roger van al laboratorio de montaña de su padre. Lord Asriel mata a Roger cortando a su demonio para crear una explosión de energía que abre una ventana a otro mundo por el que pasa Asriel. Revelando un profundo amor por su hija y una atracción duradera por Asriel, la Sra. Coulter se niega a seguirlo, pero Lyra va al otro mundo para tratar de detenerlo y vengarse de la muerte de Roger. Al mismo tiempo, en nuestro mundo, el adolescente Will atraviesa una ventana utilizada por el vicioso amante de la Sra. Coulter, Lord Boreal, para cambiar entre los mundos de Lyras y Will. Will está huyendo de matar accidentalmente al lacayo de Boreal que estaba buscando información sobre el padre de Will, el coronel John Parry, quien había desaparecido años antes en una expedición a Alaska y se sospecha que se mueve entre los mundos. Boreal descubre la existencia de un cuchillo mágico en una torre rodeada de ángeles y cree que Will es la clave para encontrarlo.
La versión más larga
Lyra Belacqua

Lyra, de 13 años, y su demonio Pan son enérgicos, atrevidos y una excelente mentirosa. Fueron criados por el Masters of Jordan College, Oxford, después de que Lord Asriel los dejó a su cuidado cuando eran bebés, a quien ella creía que era su tío, según se entera más tarde su padre. Lyra, aceptada como aprendiz de la glamorosa exploradora ártica Marisa Coulter, se muda a Londres, pero huye cuando se entera de que la Sra. Coulter es responsable de la desaparición de varios niños que fueron estafados en las calles, incluido su mejor amigo Roger. Lyra viaja al norte con viajeros acuáticos, los egipcios, muchos de los cuales fueron llevados por los «comedores» de la Sra. Coulter, para encontrar a los niños desaparecidos. En el camino, se entera de Ma Costa, la madre de un niño desaparecido, que la Sra. Coulter es su madre biológica.
Junto con Baby Lyra, Lord Asriel trajo un aletiómetro al Jordan College, un dispositivo místico del cual solo hay un puñado en el mundo que puede responder a cualquier pregunta siempre que el lector pueda interpretar sus símbolos. Cuando Lyra va a Londres, el maestro de la universidad le confía el aletiómetro y le dice que lo mantenga en secreto. Va en busca de Roger y Billy, el hijo de Gyptian Ma Costa, a quien encuentra en el norte como un caparazón moribundo, separado de su demonio. Ella y los gitanos convencen a las poderosas brujas para que apoyen su lucha, para formar equipo con el aeronauta Lee Scoresby y el depuesto rey de Panserbjørn Iorek, y para infiltrarse en las instalaciones de investigación donde Roger, Billy y los demás están experimentando. Salvas a los niños y la instalación se destruye.
Después de caer del globo de Lee Scoresby mientras era atacada por los espíritus del acantilado, Lyra es encarcelada por el rey Iofur, el usurpador de Panserbjørn del trono de Iorek. Ella usa su artimaña para involucrar a Iofur en una batalla uno a uno con el ex rey, quien está siendo devuelto al lugar que le corresponde en el trono. Los Panserbjørn llevan a Lyra y Roger al laboratorio de montaña de Lord Asriel, donde Asriel mata a Roger para abrir una ventana entre los mundos a través de los cuales pasaron primero él y luego Lyra.
Roger Parslow

Roger, un dulce cocinero huérfano y el mejor amigo de Lyra en el Jordan College, fue secuestrado por la Junta General de Oblación y enviado al norte como parte de una cohorte de niños robados. Su desaparición incita a Lyra a aceptar una oferta para entrenar en Londres de la glamorosa exploradora Sra. Coulter, quien promete ayudar a Lyra a encontrarlo. De hecho, la Sra. Coulter es la directora de la Junta General de Oblación y sabía exactamente dónde estaban Roger y los demás: en su estación de investigación experimental, donde sus demonios fueron separados de ellos por una máquina especial. La mayoría de los niños mueren en el experimento, y los que no lo hacen, como el niño egipcio Billy Costa, quedan vacíos y sin alma.